Konferenzservice Mandl

Zusammenfassung: Im Hinblick auf steigende Kosten sowie experimentellen Aufwand gewinnt der Einsatz theoretischer Verfahren besonders in der pharmazeutischen und medizinisch-technischen Chemie zunehmend an Bedeutung. Wegen der Fülle der mittlerweile zur Verfügung stehenden Software für die verschiedensten Einsatzgebiete (Durchführung von Geometrieoptimierungen und Moleküldynamiksimulationen, Berechnung von Toxizitäten sowie physikalisch-chemischer Eigenschaften usw.) ist eine Spezialisierung auf Teilbereiche fast unumgänglich. Dabei kann zwischen makroskopischen Systemen (z.B. Proteine oder DNS) sowie kleinen Molekülen (organische und anorganische Liganden) unterschieden werden. Letztere sind Gegenstand des ebenfalls von uns angebotenen Kurses 'Molecular Modelling'. Den Teilnehmern dieses Kurses wird ein Überblick über aktuell in der Forschung verwendete theoretische Konzepte und Lösungsoptionen gegeben. Dabei wird der Schwerpunkt auf die Behandlung von Proteinstrukturen gelegt. Ausgehend von einer gegebenen Aminosäuresequenz für ein Peptid oder Protein sollen Informationen über familiäre Zusammenhänge, mögliche Sekundärstrukturen bis hin zur dreidimensionalen Geometrie analysiert oder berechnet werden. Hierfür werden Methoden des Auffindens und Vergleichens homologer Sequenzabschnitte, des Sequenzalignments und der Strukturmodellierung auf Grundlage bekannter Geometrien homologer Systeme diskutiert. Speziell für Proteine wird auf Verfahren wie Geometrieoptimierungen sowie zeitabhängige Untersuchungen via Moleküldynamik-Simulationen und deren Analysemöglichkeiten eingegangen. Zur Beschreibung von Protein-Ligand Interaktionen werden exemplarische Docking-Simulationen durchgeführt.

Zusammenfassung: Der Kurs geht auf verschiedene Computermethoden in der Bio- und Chemoinformatik ein und beschreibt, welche sich für spezielle Probleme im Drug-Discovery-Prozess eignen, was erreicht werden kann und wie man in der Praxis bestimmten Schwierigkeiten begegnet. Im Kurs wird neben den theoretischen Hintergründen auch der Praxisbezug am Computer in Übungen behandelt. Themengebiete sind dabei u.a.: - Ähnlichkeitsanalysen biologischer Systeme - Molecular/Protein Modelling - Drugdesign - Methoden aus der Chemoinformatik - Leitstruktursuche und -optimierung - Pharmakophorbasiertes virtuelles Screening - Databasemining - Molecular Design und Drug Discovery Der Kurs soll für Anwender aus allen Bereichen der pharmazeutischen Forschung und der medizinischen Chemie in Forschung und Industrie - fortführend zum GDCh-Kurs 'Einführung in die Medizinische Chemie“ (siehe Kurs 169/09) - einen zweckgerichteten Einblick in gegenwärtige Einsatzmöglichkeiten der computergestützten Wirkstoffforschung geben. Die Teilnahme am Einführungskurs ist keine Voraussetzung für die Kursteilnahme. Grundkenntnisse der Medizinischen Chemie sowie der Umgang mit Computer-Anwendungen sind hilfreich.

Zielgruppe: Chemiker, Biochemiker, Mediziner, (Informatiker) im Wirkstoffforschungsbereich der Pharmaindustrie