Services aux conférences Mandl

Résumé: Im Hinblick auf steigende Kosten sowie experimentellen Aufwand gewinnt der Einsatz theoretischer Verfahren besonders in der pharmazeutischen und medizinisch-technischen Chemie zunehmend an Bedeutung. Wegen der Fülle der mittlerweile zur Verfügung stehenden Software für die verschiedensten Einsatzgebiete (Durchführung von Geometrieoptimierungen und Moleküldynamiksimulationen, Berechnung von Toxizitäten sowie physikalisch-chemischer Eigenschaften usw.) ist eine Spezialisierung auf Teilbereiche fast unumgänglich. Dabei kann zwischen makroskopischen Systemen (z.B. Proteine oder DNS) sowie kleinen Molekülen (organische und anorganische Liganden) unterschieden werden. Letztere sind Gegenstand des ebenfalls von uns angebotenen Kurses 'Molecular Modelling'. Den Teilnehmern dieses Kurses wird ein Überblick über aktuell in der Forschung verwendete theoretische Konzepte und Lösungsoptionen gegeben. Dabei wird der Schwerpunkt auf die Behandlung von Proteinstrukturen gelegt. Ausgehend von einer gegebenen Aminosäuresequenz für ein Peptid oder Protein sollen Informationen über familiäre Zusammenhänge, mögliche Sekundärstrukturen bis hin zur dreidimensionalen Geometrie analysiert oder berechnet werden. Hierfür werden Methoden des Auffindens und Vergleichens homologer Sequenzabschnitte, des Sequenzalignments und der Strukturmodellierung auf Grundlage bekannter Geometrien homologer Systeme diskutiert. Speziell für Proteine wird auf Verfahren wie Geometrieoptimierungen sowie zeitabhängige Untersuchungen via Moleküldynamik-Simulationen und deren Analysemöglichkeiten eingegangen. Zur Beschreibung von Protein-Ligand Interaktionen werden exemplarische Docking-Simulationen durchgeführt.

Résumé: Modeling and Design of Molecular Materials is a biannual conference devoted to presenting contemporary computational methods along with their applications in molecular modeling, molecular material design, bioinformatics and related fields. Participation of experimentalists interested in application molecular modeling techniques is encouraged.

Résumé: Dem Teilnehmer wird ein Überblick über die in der Industrie verwendeten theoretischen Konzepte und Lösungsoptionen für die Berechnung von Geometrieoptimierungen, Moleküldynamik, Toxizitäten und physikalisch-chemischen Eigenschaften von kleinen und makroskopischen Molekülen gegeben. Anhand praktischer Übungen am Rechner werden u.a. Protein-Ligand Wechselwirkungen und quantitative Struktur-Wirkungs- bzw. Eigenschaftsbeziehungen entwickelt. Hierbei kommen Kraftfeldverfahren, semiempirische, ab-initio und DFT-Verfahren zum Einsatz, deren Anwendungsmöglichkeiten verglichen werden.